Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Snx25Q3ZT31 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx25Q3ZT31 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx25Q3ZT31 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx25Q3ZT31 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx25Q3ZT31 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx25Q3ZT31 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Snx25Q3ZT31 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Snx25Q3ZT31 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Snx25Q3ZT31 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx25Q3ZT31 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx25Q3ZT31 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx25Q3ZT31 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Snx25Q3ZT31 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Snx25Q3ZT31 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx25Q3ZT31 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx25Q3ZT31 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx25Q3ZT31 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx25Q3ZT31 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx25Q3ZT31 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx25Q3ZT31 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx25Q3ZT31 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Snx25Q3ZT31 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Snx25Q3ZT31 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Snx25Q3ZT31 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Snx25Q3ZT31 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Snx25Q3ZT31 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx25Q3ZT31 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Snx25Q3ZT31 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Snx25Q3ZT31 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx25Q3ZT31 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Snx25Q3ZT31 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx25Q3ZT31 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx25Q3ZT31 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx25Q3ZT31 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx25Q3ZT31 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx25Q3ZT31 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx25Q3ZT31 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx25Q3ZT31 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx25Q3ZT31 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx25Q3ZT31 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx25Q3ZT31 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx25Q3ZT31 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms