Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZAS0

Slc9a2, Sodium/hydrogen exchanger, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a2Q3ZAS0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc9a2Q3ZAS0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms