Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pacs2Q3V3Q7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pacs2Q3V3Q7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pacs2Q3V3Q7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms