Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2W7

4930518I15Rik, RIKEN cDNA 4930518I15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930518I15RikQ3V2W7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
4930518I15RikQ3V2W7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
4930518I15RikQ3V2W7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
4930518I15RikQ3V2W7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
4930518I15RikQ3V2W7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
4930518I15RikQ3V2W7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
4930518I15RikQ3V2W7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
4930518I15RikQ3V2W7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930518I15RikQ3V2W7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms