Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms