Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930596D02RikQ3V0H9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms