Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3V0E1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3V0E1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3V0E1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3V0E1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3V0E1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3V0E1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms