Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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