Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk4Q3V016 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms