Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed1Q3V009 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed1Q3V009 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed1Q3V009 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed1Q3V009 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed1Q3V009 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed1Q3V009 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed1Q3V009 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms