Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prdm6Q3UZD5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prdm6Q3UZD5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms