Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms