Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc114Q3UX62 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms