Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E330034G19RikQ3UWX6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms