Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim40Q3UWA4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim40Q3UWA4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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