Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1d1Q3UV55 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms