Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
B230104I21RikQ3USW4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms