Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms