Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Znf48Q3US17 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Znf48Q3US17 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Znf48Q3US17 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Znf48Q3US17 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Znf48Q3US17 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Znf48Q3US17 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Znf48Q3US17 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Znf48Q3US17 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Znf48Q3US17 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Znf48Q3US17 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Znf48Q3US17 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Znf48Q3US17 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Znf48Q3US17 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf48Q3US17 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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