Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E130208F15RikQ3UPV3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.6 ms