Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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D13Ertd608eQ3UPR8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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D13Ertd608eQ3UPR8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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D13Ertd608eQ3UPR8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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D13Ertd608eQ3UPR8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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D13Ertd608eQ3UPR8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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D13Ertd608eQ3UPR8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
D13Ertd608eQ3UPR8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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