Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms