Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms