Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms