Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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