Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b2Q3UJB0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms