Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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