Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms