Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx27Q3UHD6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms