Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms