Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn7l3bQ3UD01 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms