Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms