Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U595 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U595 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U595 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U595 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U595 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U595 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U595 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U595 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U595 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U595 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U595 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U595 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U595 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U595 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U595 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U595 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U595 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U595 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U595 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U595 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U595 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U595 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U595 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U595 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U595 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U595 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U595 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U595 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U595 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U595 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U595 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U595 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U595 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U595 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U595 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U595 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U595 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U595 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U595 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U595 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U595 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U595 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U595 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U595 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U595 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U595 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U595 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U595 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U595 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U595 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U595 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q3U595 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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