Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Olfr1511-202ENSMUST00000214168 1468 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm29018-201ENSMUST00000188707 925 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm29436-202ENSMUST00000189054 1172 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam117bQ3U3E2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms