Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc174Q3U155 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc174Q3U155 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms