Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem35bQ3U0Y2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms