Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms