Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Lrrc28Q3TX51 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Lrrc28Q3TX51 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Lrrc28Q3TX51 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Lrrc28Q3TX51 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Lrrc28Q3TX51 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Lrrc28Q3TX51 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Lrrc28Q3TX51 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Lrrc28Q3TX51 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc28Q3TX51 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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