Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ccdc136Q3TVA9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc136Q3TVA9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms