Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Fam107bQ3TGF2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam107bQ3TGF2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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