Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RubcnlQ3TD16 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RubcnlQ3TD16 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms