Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc127Q3TC33 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms