Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hddc2Q3SXD3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms