Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
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Shroom4Q1W617 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
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Shroom4Q1W617 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
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Shroom4Q1W617 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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Shroom4Q1W617 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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Shroom4Q1W617 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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Shroom4Q1W617 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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Shroom4Q1W617 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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Shroom4Q1W617 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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Shroom4Q1W617 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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Shroom4Q1W617 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
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Shroom4Q1W617 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms