Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo3bQ1EG27 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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