Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Rpusd3Q14AI6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Rpusd3Q14AI6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd3Q14AI6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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