Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 456.1 ms