Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp2b3Q0VF55 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms