Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne7Q0VE82 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms