Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rundc1Q0VDN7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rundc1Q0VDN7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms